Build triggered by workflow dispatch

Author: openMINDS pipeline

code/types/latest/+openminds/+controlledterms/UBERONParcellation.m

@@ -74,6 +74,7 @@
             "PurkinjeCellLayerCorpusCerebelli", ...
             "PurkinjeCellLayerOfCerebellarCortex", ...
             "PurkinjeCellLayerValvulaCerebelli", ...
+            "ReissnersFiber", ...
             "abdomenNerve", ...
             "abdominalGanglion", ...
             "abdominalGanglionOfVisceralHump", ...
@@ -1666,9 +1667,12 @@
             "ramusRecurrens", ...
             "ramusSuperficialOphthalmic", ...
             "ramusSupraotic", ...
+            "ramusVentral", ...
             "redNucleus", ...
             "regionalPartOfBrain", ...
             "regionalPartOfCerebellarCortex", ...
+            "remnantOfLumenOfRathkesPouch", ...
+            "remnantOfRathkesPouch", ...
             "reticularFormation", ...
             "reticulospinalTract", ...
             "reticulotegmentalNucleus", ...
@@ -1677,8 +1681,10 @@
             "retinalTapetumLucidum", ...
             "retrochiasmaticArea", ...
             "retrohippocampalRegion", ...
+            "retrolenticularPartOfInternalCapsule", ...
             "retrorubralAreaOfMidbrainReticularNucleus", ...
             "retrosplenialGranularCortex", ...
+            "retrosplenialRegion", ...
             "retrotrapezoidNucleus", ...
             "reuniensNucleus", ...
             "rhinalSulcus", ...
@@ -1715,15 +1721,21 @@
             "rhombomereFloorPlate", ...
             "rhombomereRoofPlate", ...
             "rightAuditoryCortex", ...
+            "rightCerebralHemisphere", ...
+            "rightDorsalThalamus", ...
             "rightFrontalLobe", ...
             "rightHemisphereOfCerebellum", ...
             "rightLateralVentricle", ...
             "rightLimbicLobe", ...
             "rightOccipitalLobe", ...
             "rightParietalLobe", ...
+            "rightPutamen", ...
+            "rightSubLobarRegion", ...
             "rightTemporalLobe", ...
             "roofPlateOfDiencephalon", ...
+            "roofPlateOfMedullaOblongata", ...
             "roofPlateOfMetencephalon", ...
+            "roofPlateOfMidbrain", ...
             "roofPlateOfTelencephalon", ...
             "rostralAnteriorCingulateCortex", ...
             "rostralCA1", ...
@@ -1741,11 +1753,18 @@
             "rostralPortionOfTheMedialAccessoryOlive", ...
             "rostralSpinocerebellarTract", ...
             "rostralSulcus", ...
+            "rostralVentrolateralMedulla", ...
             "rostrolateralAreaLayer5", ...
             "rostrolateralVisualArea", ...
             "rostrumOfCorpusCallosum", ...
             "rubrospinalTract", ...
+            "sacculeOfMembranousLabyrinth", ...
+            "saccusDorsalis", ...
+            "saccusVasculosus", ...
             "sacralDorsalRootGanglion", ...
+            "sagitta", ...
+            "sagittalSinus", ...
+            "sagittalStratum", ...
             "sagittalSulcus", ...
             "secondCervicalDorsalRootGanglion", ...
             "secondLumbarDorsalRootGanglion", ...
@@ -1754,6 +1773,7 @@
             "secondaryAuditoryCortex", ...
             "secondaryFissureOfCerebellum", ...
             "secondaryGustatoryTract", ...
+            "secondaryMuscleSpindle", ...
             "secondaryOlfactoryCortex", ...
             "secondaryProsencephalon", ...
             "secondarySomatosensoryCortex", ...
@@ -1764,6 +1784,7 @@
             "sensorimotorSystem", ...
             "sensoryCircumventricularOrgan", ...
             "sensoryDissociationArea", ...
+            "sensoryEpithelium", ...
             "sensoryGanglion", ...
             "sensoryReceptor", ...
             "septalNuclearComplex", ...
@@ -1774,7 +1795,9 @@
             "septumPellucidum", ...
             "seventhCervicalDorsalRootGanglion", ...
             "seventhThoracicDorsalRootGanglion", ...
+            "sheathOfSchwann", ...
             "shellOfNucleusAccumbens", ...
+            "sigmoidSinus", ...
             "sixthCervicalDorsalRootGanglion", ...
             "sixthThoracicDorsalRootGanglion", ...
             "solitaryTract", ...
@@ -1784,12 +1807,14 @@
             "somaticSensorySystem", ...
             "somatosensoryCortex", ...
             "sommersSector", ...
+            "sphenoparietalSinus", ...
             "spinalCordArachnoidMater", ...
             "spinalCordMantleLayer", ...
             "spinalCordPiaMater", ...
             "spinalCordSulcusLimitans", ...
             "spinalCordVentricularLayer", ...
             "spinalDuraMater", ...
+            "spinalNeuromere", ...
             "spinalTrigeminalTract", ...
             "spinalTrigeminalTractOfMedulla", ...
             "spinalTrigeminalTractOfPons", ...
@@ -1802,6 +1827,9 @@
             "spinothalamicTractOfPons", ...
             "spleniumOfTheCorpusCallosum", ...
             "spurOfArcuateSulcus", ...
+            "statoacousticEpithelium", ...
+            "statoconialMembrane", ...
+            "stratumFibrosumEtGriseumSuperficiale", ...
             "stratumLacunosumMoleculareOfCaudalCA1", ...
             "stratumLacunosumMoleculareOfCaudalCA2", ...
             "stratumLacunosumMoleculareOfCaudalCA3", ...
@@ -1811,9 +1839,12 @@
             "stratumLacunosumMoleculareOfUncalCA1", ...
             "stratumLacunosumMoleculareOfUncalCA2", ...
             "stratumLacunosumMoleculareOfUncalCA3", ...
+            "stratumLemnisciOfSuperiorColliculus", ...
             "stratumLucidumOfCaudalCA3", ...
             "stratumLucidumOfRostralCA3", ...
             "stratumLucidumOfUncalCA3", ...
+            "stratumMarginale", ...
+            "stratumOpticum", ...
             "stratumOriensOfCaudalCA1", ...
             "stratumOriensOfCaudalCA2", ...
             "stratumOriensOfCaudalCA3", ...
@@ -1823,6 +1854,7 @@
             "stratumOriensOfUncalCA1", ...
             "stratumOriensOfUncalCA2", ...
             "stratumOriensOfUncalCA3", ...
+            "stratumPeriventriculare", ...
             "stratumPyramidaleOfCaudalCA1", ...
             "stratumPyramidaleOfCaudalCA2", ...
             "stratumPyramidaleOfCaudalCA3", ...
@@ -1843,12 +1875,14 @@
             "stratumRadiatumOfUncalCA3", ...
             "stratumZonaleOfThalamus", ...
             "striaMedullaris", ...
+            "striaOfNeuraxis", ...
             "striaOfTelencephalon", ...
             "striaTerminalis", ...
             "striatum", ...
             "striosomalPartOfBodyOfCaudateNucleus", ...
             "striosomalPartOfCaudateNucleus", ...
             "striosomalPartOfPutamen", ...
+            "striosome", ...
             "subarachnoidFissure", ...
             "subarachnoidSpace", ...
             "subarachnoidSulcus", ...

code/types/v3.0/+openminds/+controlledterms/UBERONParcellation.m

@@ -74,6 +74,7 @@
             "PurkinjeCellLayerCorpusCerebelli", ...
             "PurkinjeCellLayerOfCerebellarCortex", ...
             "PurkinjeCellLayerValvulaCerebelli", ...
+            "ReissnersFiber", ...
             "abdomenNerve", ...
             "abdominalGanglion", ...
             "abdominalGanglionOfVisceralHump", ...
@@ -1666,9 +1667,12 @@
             "ramusRecurrens", ...
             "ramusSuperficialOphthalmic", ...
             "ramusSupraotic", ...
+            "ramusVentral", ...
             "redNucleus", ...
             "regionalPartOfBrain", ...
             "regionalPartOfCerebellarCortex", ...
+            "remnantOfLumenOfRathkesPouch", ...
+            "remnantOfRathkesPouch", ...
             "reticularFormation", ...
             "reticulospinalTract", ...
             "reticulotegmentalNucleus", ...
@@ -1677,8 +1681,10 @@
             "retinalTapetumLucidum", ...
             "retrochiasmaticArea", ...
             "retrohippocampalRegion", ...
+            "retrolenticularPartOfInternalCapsule", ...
             "retrorubralAreaOfMidbrainReticularNucleus", ...
             "retrosplenialGranularCortex", ...
+            "retrosplenialRegion", ...
             "retrotrapezoidNucleus", ...
             "reuniensNucleus", ...
             "rhinalSulcus", ...
@@ -1715,15 +1721,21 @@
             "rhombomereFloorPlate", ...
             "rhombomereRoofPlate", ...
             "rightAuditoryCortex", ...
+            "rightCerebralHemisphere", ...
+            "rightDorsalThalamus", ...
             "rightFrontalLobe", ...
             "rightHemisphereOfCerebellum", ...
             "rightLateralVentricle", ...
             "rightLimbicLobe", ...
             "rightOccipitalLobe", ...
             "rightParietalLobe", ...
+            "rightPutamen", ...
+            "rightSubLobarRegion", ...
             "rightTemporalLobe", ...
             "roofPlateOfDiencephalon", ...
+            "roofPlateOfMedullaOblongata", ...
             "roofPlateOfMetencephalon", ...
+            "roofPlateOfMidbrain", ...
             "roofPlateOfTelencephalon", ...
             "rostralAnteriorCingulateCortex", ...
             "rostralCA1", ...
@@ -1741,11 +1753,18 @@
             "rostralPortionOfTheMedialAccessoryOlive", ...
             "rostralSpinocerebellarTract", ...
             "rostralSulcus", ...
+            "rostralVentrolateralMedulla", ...
             "rostrolateralAreaLayer5", ...
             "rostrolateralVisualArea", ...
             "rostrumOfCorpusCallosum", ...
             "rubrospinalTract", ...
+            "sacculeOfMembranousLabyrinth", ...
+            "saccusDorsalis", ...
+            "saccusVasculosus", ...
             "sacralDorsalRootGanglion", ...
+            "sagitta", ...
+            "sagittalSinus", ...
+            "sagittalStratum", ...
             "sagittalSulcus", ...
             "secondCervicalDorsalRootGanglion", ...
             "secondLumbarDorsalRootGanglion", ...
@@ -1754,6 +1773,7 @@
             "secondaryAuditoryCortex", ...
             "secondaryFissureOfCerebellum", ...
             "secondaryGustatoryTract", ...
+            "secondaryMuscleSpindle", ...
             "secondaryOlfactoryCortex", ...
             "secondaryProsencephalon", ...
             "secondarySomatosensoryCortex", ...
@@ -1764,6 +1784,7 @@
             "sensorimotorSystem", ...
             "sensoryCircumventricularOrgan", ...
             "sensoryDissociationArea", ...
+            "sensoryEpithelium", ...
             "sensoryGanglion", ...
             "sensoryReceptor", ...
             "septalNuclearComplex", ...
@@ -1774,7 +1795,9 @@
             "septumPellucidum", ...
             "seventhCervicalDorsalRootGanglion", ...
             "seventhThoracicDorsalRootGanglion", ...
+            "sheathOfSchwann", ...
             "shellOfNucleusAccumbens", ...
+            "sigmoidSinus", ...
             "sixthCervicalDorsalRootGanglion", ...
             "sixthThoracicDorsalRootGanglion", ...
             "solitaryTract", ...
@@ -1784,12 +1807,14 @@
             "somaticSensorySystem", ...
             "somatosensoryCortex", ...
             "sommersSector", ...
+            "sphenoparietalSinus", ...
             "spinalCordArachnoidMater", ...
             "spinalCordMantleLayer", ...
             "spinalCordPiaMater", ...
             "spinalCordSulcusLimitans", ...
             "spinalCordVentricularLayer", ...
             "spinalDuraMater", ...
+            "spinalNeuromere", ...
             "spinalTrigeminalTract", ...
             "spinalTrigeminalTractOfMedulla", ...
             "spinalTrigeminalTractOfPons", ...
@@ -1802,6 +1827,9 @@
             "spinothalamicTractOfPons", ...
             "spleniumOfTheCorpusCallosum", ...
             "spurOfArcuateSulcus", ...
+            "statoacousticEpithelium", ...
+            "statoconialMembrane", ...
+            "stratumFibrosumEtGriseumSuperficiale", ...
             "stratumLacunosumMoleculareOfCaudalCA1", ...
             "stratumLacunosumMoleculareOfCaudalCA2", ...
             "stratumLacunosumMoleculareOfCaudalCA3", ...
@@ -1811,9 +1839,12 @@
             "stratumLacunosumMoleculareOfUncalCA1", ...
             "stratumLacunosumMoleculareOfUncalCA2", ...
             "stratumLacunosumMoleculareOfUncalCA3", ...
+            "stratumLemnisciOfSuperiorColliculus", ...
             "stratumLucidumOfCaudalCA3", ...
             "stratumLucidumOfRostralCA3", ...
             "stratumLucidumOfUncalCA3", ...
+            "stratumMarginale", ...
+            "stratumOpticum", ...
             "stratumOriensOfCaudalCA1", ...
             "stratumOriensOfCaudalCA2", ...
             "stratumOriensOfCaudalCA3", ...
@@ -1823,6 +1854,7 @@
             "stratumOriensOfUncalCA1", ...
             "stratumOriensOfUncalCA2", ...
             "stratumOriensOfUncalCA3", ...
+            "stratumPeriventriculare", ...
             "stratumPyramidaleOfCaudalCA1", ...
             "stratumPyramidaleOfCaudalCA2", ...
             "stratumPyramidaleOfCaudalCA3", ...
@@ -1843,12 +1875,14 @@
             "stratumRadiatumOfUncalCA3", ...
             "stratumZonaleOfThalamus", ...
             "striaMedullaris", ...
+            "striaOfNeuraxis", ...
             "striaOfTelencephalon", ...
             "striaTerminalis", ...
             "striatum", ...
             "striosomalPartOfBodyOfCaudateNucleus", ...
             "striosomalPartOfCaudateNucleus", ...
             "striosomalPartOfPutamen", ...
+            "striosome", ...
             "subarachnoidFissure", ...
             "subarachnoidSpace", ...
             "subarachnoidSulcus", ...